| Homo sapiens Protein: DEPDC1 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-99610.7 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | DEPDC1 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | DEP domain containing 1 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000360005 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-99608 (DEPDC1) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | May be involved in transcriptional regulation as a transcriptional corepressor. The DEPDC1A-ZNF224 complex may play a critical role in bladder carcinogenesis by repressing the transcription of the A20 gene, leading to transport of NF-KB protein into the nucleus, resulting in suppression of apoptosis of bladder cancer cells. {ECO:0000269PubMed:20587513}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:17452976, ECO:0000269PubMed:20587513}. Note=Colocalizes with ZNF224 at the nucleus. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Expressed in testis. Up-regulated in bladder cancer cells (at protein level). {ECO:0000269PubMed:17452976}. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR000198
Rho GTPase-activating protein domain IPR000591 DEP domain IPR008936 Rho GTPase activation protein |
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| PFAM |
PF00620
PF00610 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00324
SM00049 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q5TB30 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q5TB30 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | E9PL61 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 55635 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.641921 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_060249 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:22949 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 612002 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS644 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 10879 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AB281187 AB281274 AJ278112 AK000490 AK022792 AL138789 AL139413 BC003511 BC065304 CH471059 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH03511 AAH65304 BAA91201 BAB14246 BAF91373 BAF91374 CAB92444 CAI22441 CAI22442 CAI22443 EAX06475 EAX06476 | ||||||||||||||||||