Homo sapiens Protein: IRF3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-63229.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IRF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | interferon regulatory factor 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000366344 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-63225 (IRF3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Key transcriptional regulator of type I interferon (IFN)-dependent immune responses which plays a critical role in the innate immune response against DNA and RNA viruses. Regulates the transcription of type I IFN genes (IFN-alpha and IFN-beta) and IFN-stimulated genes (ISG) by binding to an interferon-stimulated response element (ISRE) in their promoters. Acts as a more potent activator of the IFN-beta (IFNB) gene than the IFN-alpha (IFNA) gene and plays a critical role in both the early and late phases of the IFNA/B gene induction. Found in an inactive form in the cytoplasm of uninfected cells and following viral infection, double-stranded RNA (dsRNA), or toll-like receptor (TLR) signaling, is phosphorylated by IKBKE and TBK1 kinases. This induces a conformational change, leading to its dimerization and nuclear localization and association with CREB binding protein (CREBBP) to form dsRNA-activated factor 1 (DRAF1), a complex which activates the transcription of the type I IFN and ISG genes. Can activate distinct gene expression programs in macrophages and can induce significant apoptosis in primary macrophages. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:10805757}. Nucleus {ECO:0000269PubMed:10805757}. Note=Shuttles between cytoplasmic and nuclear compartments, with export being the prevailing effect. When activated, IRF3 interaction with CREBBP prevents its export to the cytoplasm. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed constitutively in a variety of tissues. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 156 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 21 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001346
Interferon regulatory factor DNA-binding domain IPR008984 SMAD/FHA domain IPR019471 Interferon regulatory factor-3 |
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PFAM |
PF00605
PF10401 |
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PRINTS |
PR00267
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00348
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q14653 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q14653 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q71U93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.75254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB102884 AB102886 AB102887 AC011495 AF112181 AK292027 AK314421 BC000660 BC071721 CH471177 U86636 Z56281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC68818 AAD05262 AAH00660 AAH71721 BAD89413 BAD89415 BAD89416 BAF84716 BAG37040 CAA91227 EAW52510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||